A项:员工黄某完成的软件是利用乙软件公司物质条件完成的，因此该作品属于职务作品；该软件完成后为乙软件公司单位发明；同时，该软件为甲汽车公司委托乙软件公司开发，为委托作品，约定著作权归甲公司所有，因此，该软件著作权归属于甲汽车公司。A项正确；

B项：丙汽车公司未经同意，使用甲汽车公司的软件，构成侵权，其安装在自己生产的汽车上的行为侵犯了甲汽车公司的复制权、发行权；B项正确；

C项：丙汽车公司即使为不知情的侵权复制件持有人，仍构成侵权，只是不承担赔偿责任；C项错误；

D项：黄某作为技术人员对公司负有保密义务，现擅自将所持有的技术转让给不知情的丙汽车公司，构成违约，需承担违约责任，D项错误。

综上所述，本题正确答案为A、B、D项。